ところが、葉緑体のDNAを調べてみると驚きの事実が判明します。
なんと日本、中国、ネパール、ブータンなど アジア各地で調べた栽培アズキ の葉緑体DNAは、すべて日本産の野生アズキと同じ型であり、中国の野生種とは明確に異なっていたのです。
調査範囲の栽培アズキが例外なく日本の野生型の葉緑体を持つということは、栽培化されたアズキの母親（起源）が日本にあることを強力に示す証拠です。
では、なぜ核ゲノムでは中国起源のように見えたのでしょうか。
その謎を解くため、研究グループは核DNAの配列をさらに詳しく分析しました。
すると、中国の栽培アズキの遺伝的多様性が高い理由は、中国に渡ったアズキが現地の野生種と交雑（交配）していたためだと考えられることがわかりました。
すなわち、アズキは日本で野生種から栽培化（domestication）され、その後に中国へ伝わったものの、そこで中国の野生アズキと交雑して遺伝的に多様化したというシナリオです。
この一連の結果は、日本起源説を支持する近年の考古学的知見とも見事に合致し、長年の論争に決着をつけるものとなりました。
研究チームは「今回の成果は考古学の最新研究とも一致しており、詳細なゲノム解析で作物進化の謎を解き明かした好例です」とコメントしています。
