一方で“愛車との時間に、誇りを”と謳うN-BOXカスタムは、立体感のある緻密な造形のフロントグリルやフロントの横一文字LEDライト、ダイレクトプロジェクション式LEDヘッドライト（ホンダ初）を採用し、また歴代モデルで築いてきたN-BOXカスタムらしいクリアレンズのリアコンビネーションランプ、ロー＆ワイドな見え方と空力性能を考慮した専用のエアロデザインにより、品格のある佇まいと性能の高さを表現する。また、コーディネートスタイルはダーククロームメッキ加飾のフロントグリル、アウタードアハンドル、リアライセンスガーニッシュや、ベルリナブラック塗装＋切削アルミホイールなどを採用するとともに、モノトーンカラーに加えてルーフ色をブラックでアレンジした2トーンカラーを設定し、より精悍で存在感のあるルックスを創出した。インテリアについては、ブラック基調の空間にクロームメッキのアクセントを配して、上質かつスポーティなコクピットを演出。コーディネートスタイルには、グレーステッチの本革巻きステアリングやプライムスムースドアライニングアームレスト、ダークヘマタイト塗装ドアオーナメントパネルなども配備する。シート表皮はN-BOXカスタムにブラックのトリコットを、N-BOXカスタム ターボにブラック×ブラックのプライムスムース／トリコット（スエード調）を、N-BOXカスタム コーディネートスタイルおよびN-BOXカスタム ターボ コーディネートスタイルにブラック×カーボン調プライムスムースを採用。ボディカラーはN-BOXカスタムおよびN-BOXカスタム ターボにプラチナホワイトパール／プレアミムサンライトホワイトパール／メテオロイドグレーメタリック／ミッドナイトブルービームメタリック／クリスタルブラックパール／トワイライトミストブラックパールを、N-BOXカスタム コーディネートスタイルおよびN-BOXカスタム ターボ コーディネートスタイルにプラチナホワイトパール／プレミアムクリスタルレッドメタリック／スレートグレーパール／プラチナホワイトパール＆ブラック／プレミアムクリスタルレッドメタリック＆ブラック／スレートグレーパール＆ブラックをラインアップした。
