また芽殖孤虫のゲノムはマンソン裂頭条虫（8億塩基対）と似ている部分があったものの、塩基配列およびゲノム数からも明らかに別の生物であると判明します。
かつて芽殖孤虫はマンソン裂頭条虫の異常個体であるとする説がありましたが、今回の研究によって完全に否定されました。
ですがより興味深い発見は、個々の遺伝子解析によってみえてきました。
芽殖孤虫に含まれる遺伝子を調べた結果、卵から体を作るために必要な「個体発生」にかかわる遺伝子や有性生殖に必要な10個の遺伝子について重要度（選択圧）が低下していることが判明。
また神経系を作る遺伝子や体の前後を決める遺伝子（Hox1）など、体の正しい形成に重要な遺伝子のいくつかが失われていることも判明します。
この結果は芽殖孤虫は卵を産む成虫段階が存在せず、増殖がもっぱら出芽・分裂という無性生殖に依存していることを示します。
そしてこの無性的な増殖が芽殖孤虫の病原性の強さに直結していると考えられます。
ただ興味深いことに芽殖孤虫の全ての虫体が終末的な増殖を起こすわけではありませんでした。
「芽殖孤虫」は異なる2タイプがあったのです。
分裂が盛んなメデューサ型は未知のタンパク質を分泌している
研究チームが、マウスから取り出した虫体を観察していると、あるとき、盛んに出芽・分裂しているものと、出芽がみられない増殖度の遅いものがあることに気付きました。
そして増殖度が高いものを「メデューサ型」、低いものを「ワサビ型」と命名します。
次に研究チームは、これら2タイプでは何がどう違うかを顕微鏡レベルで調べることにしました。
結果、メデューサ型はワサビ型に比べて動きが活発で、とく発達した液胞を持っていることがわかりました。
