Twitterで特定のアカウントをミュートしても、基本的にバレることはありません。しかし、「ミュートされているかも」という疑問を抱いた場合「本当にミュートされているか」は高精度で特定可能。相手にミュートされているか確認する方法を、画像付きで解説します。
Twitterの「ミュート」とは – ミュートは相手にバレることもある
Twitterの「ミュート」とは、相手のアカウントのリムーブやブロックを行うことなく、相手のツイートをタイムライン上に表示しないようにできる機能です。
以下の方法でアカウントをミュートできます。

この方法でミュートしても、相手に「○○さんにミュートされました」などの通知が届くことはありません。ただし、ミュートされているかどうかを確認し、高い方法で特定できる方法があるので、以下でご紹介します。
Twitterで相手にミュートされているかすぐ確認する方法
Twitterで相手にミュートされても通知は届きません。本章では、相手が自分をミュートしているか調べる方法について、下記2つのパターンに分けて解説します。
・相手にフォローされていない場合
・相手にフォローされている場合
【フォローされていない場合】リプライを送信して反応を伺う
フォローされていない相手にリプライを送っても反応がない場合、相手にミュートされている可能性があります。なぜなら、フォローしていない相手をミュートすると、その相手が自分にリプライを送信しても見ることができない仕様になっているためです。

なお、筆者が検証した結果、2022年5月現在、DMの場合はフォロー/非フォローに限らず、ミュートしていても届いてしまいます。
【フォローされている場合】ブロ解とリプライの併用
相手からフォローされている場合は、まず相手からのフォローを外して検証を行いましょう。 ミュートしているフォロワーがリプライを送った場合、その通知はミュートしている側には届きませんが、メッセージ自体はミュートしている側も見ることができます。
つまり、フォローされている状態ではミュートされているかどうかの検証が難しくなるため、まず「ブロ解」して相手からフォローされていない場合を作りましょう。ブロ解とは、相手を一度ブロックしてから、そのブロックを解除する作業のことです。
ブロ解は以下の手順で行います。

ブロ解をしたあとにリプライを送り、相手からのリプライや「いいね」などの反応がなければ、ミュートされている可能性が高いと考えられます。
【フォローされている場合】フォロワー削除とリプライの併用
ブラウザ版Twitterでは、「フォロワーを削除」機能が使えます。これは、ブロ解と同じように「相手からフォローされていない」状態を作り出せる機能です。以下の手順でフォロワーを削除することができます。

ブロ解と同じように、この方法でもフォロワー削除後にリプライを送り、相手からのリプライや「いいね」などの反応がなければ、ミュートされている可能性が高いと考えられます。